Устойчивые E. coli у собак: что показало исследование и известен ли риск для владельца

Что учитывать: Разбор относится к сохранённому полному тексту основной статьи DOI 10.1128/spectrum.00087-25. Сохранены отдельно исходная выборка 1 000 собак, 85 изолятов в результатах и 89 изолятов в описании секвенирования; причина различия не установлена. Генетическая классификация множественной устойчивости не заменяет фенотипическое тестирование. Учтено отсутствие предсказанных генов ESBL у восьми изолятов после фенотипического отбора. Данные клиники на севере Германии, собранные в 2017 году, не устанавливают распространённость у всех собак, индивидуальный риск для владельца или направление передачи. Прямую передачу между собаками и людьми авторы не исследовали. Подробные результаты приложения и различия отдельных генов вирулентности здесь не разобраны. Практическое объяснение границ применения результатов является редакционной интерпретацией; схема лечения из исследования не выводится.

Что показало исследование

У обследованных собак обнаружили E. coli, вырабатывающие бета-лактамазы расширенного спектра — ESBL. Геномный анализ выявил признаки устойчивости к нескольким классам антибиотиков и генетически близкие бактерии у части собак общего происхождения. Передачу бактерий от собак людям в этой работе напрямую не исследовали.

На чём основано · 1

Исследование включало 1000 ректальных мазков от здоровых и больных собак ветеринарной клиники на севере Германии, собранных в 2017 году; владельцы заполняли анкету.

Граница вывода: Выборка относится к пациентам конкретной клиники и указанному периоду; представительность для общей популяции собак этим описанием не установлена.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Точное место: MATERIALS AND METHODS → первый абзац: место, год, сбор образцов и анкетирование; DOI 10.1128/spectrum.00087-25, редакция 1499

Источник: Marco Werhahn Beining, Sebastian Guenther, Antina Lüebke-Becker и др. Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany. Microbiology Spectrum, 2025. DOI: 10.1128/spectrum.00087-25

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

In this study, we examined 1,000 rectal swabs obtained from healthy and diseased dogs from a veterinary clinic in northern Germany in 2017. All dogs were examined for health status, and a questionnaire was completed by the owner.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Точное место: RESULTS AND DISCUSSION → The presence of ESBL-producing E. coli in dogs → первый абзац; DOI 10.1128/spectrum.00087-25, зарегистрированная редакция 1499

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 2

В разделе результатов авторы сообщают о 85 положительных изолятах ESBL-продуцирующей E. coli при обследовании 1000 собак; 16 из этих изолятов получены от больных собак.

Граница вывода: Обнаружение бактерии в ректальном мазке не устанавливает по этим данным причину заболевания. Число положительных изолятов нельзя представлять как число вызванных ими инфекций.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 3

Численности в статье расходятся: методы описывают полногеномное секвенирование 89 ESBL-продуцирующих изолятов с заполненными анкетами, тогда как результаты сообщают о 85 положительных изолятах.

Граница вывода: Нельзя самостоятельно исправлять одно число по другому или объяснять расхождение исключением образцов без подтверждения источником.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Точное место: MATERIALS AND METHODS → абзац о полногеномном секвенировании; число 89 следует сохранять отдельно от 85 в результатах; DOI 10.1128/spectrum.00087-25, редакция 1499

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

ESBL-producing isolates with completed questionnaires (89 in total) were subjected to whole-genome sequencing on an Illumina MiSeq/NovaSeq 6000 (GATCEurofins-9).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 4

Гены устойчивости к трём или более классам антибиотиков обнаружены у 59 из 85 анализируемых изолятов; авторы приводят долю 69% и относят эти изоляты к множественно устойчивым по использованному генетическому критерию.

Граница вывода: Наличие генов не обязательно означает их фенотипическое проявление; авторы подчёркивают необходимость дополнять геномные данные фенотипическим исследованием устойчивости. Эта доля не характеризует всех собак и не является частотой неудачного лечения.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Точное место: RESULTS AND DISCUSSION → Resistance profiles of the isolated strains → абзац, начинающийся Of the analyzed isolates; DOI 10.1128/spectrum.00087-25, редакция 1499

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Of the analyzed isolates, 69% (59 of 85) carried antibiotic resistance genes against three or more antibiotic classes listed by Magiorakos et al. (45) for Enterobacteriaceae and were therefore classified as MDR (45). The comparison of resistance genes between isolates from sick and healthy animals did not reveal any statistically significant differences (P = 0.14). Interestingly, when comparing isolates grouped into commonly pathogenic phylogroups (B2, D, and F) with isolates from commonly apathogenic phylogroups (A, B1, C, and E) (46), a significantly higher number of resistance genes was found in isolates from the commensal phylogroups (P = 0.02, CI: 0.36–6.34; Fig. S1A and B). However, it is important to note that the presence of resistance genes does not necessarily equate to their phenotypic expression or penetrance, which depends on factors such as gene regulation, expression levels, and environmental conditions. This highlights the importance of complementing genomic data with phenotypic resistance testing for a more comprehensive understanding of AMR.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 5

Кластер I линии ST744 включал четыре изолята от собак одного заводчика; внутри этого кластера авторы сообщают об отсутствии различий по анализируемым однонуклеотидным позициям общего генома.

Граница вывода: Генетическое сходство и общее происхождение собак сами по себе не устанавливают направление передачи или конкретный механизм распространения. Результат относится к указанной подгруппе.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Точное место: RESULTS AND DISCUSSION → Phylogenetic relationships → абзац Four distinct clusters, описание кластера I ST744; Fig. 2; DOI 10.1128/spectrum.00087-25, редакция 1499

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Four distinct clusters were identified in the phylogenetic tree of ST744. Two of these clusters, clusters I and IV, each contained four samples, while clusters II and III contained two samples each. The core SNP differences ranged from a maximum of 114 to a minimum of 0 (isolates within cluster I). Notably, cluster I of ST744 included isolates from dogs originating from the same breeder (Fig. 2), indicating the circulation of this clonal lineage among animals living in the same household (34, 35) and may be influenced by shared litter boxes and caregivers (7, 36, 37).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 6

Непосредственную передачу бактерий между собаками и людьми в этом исследовании не изучали.

Граница вывода: Отсутствие исследования передачи не доказывает ни её отсутствия, ни её наличия в конкретном доме; численную вероятность передачи по этой работе определить нельзя.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Точное место: RESULTS AND DISCUSSION → Conclusions → предложение о границах исследования передачи между собаками и людьми; DOI 10.1128/spectrum.00087-25, редакция 1499

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

While direct transmission between dogs and humans was not investigated, the presence of similar lineages across species reinforces the need for continuous surveillance at the animal-human interface.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Как проводили исследование

Это наблюдательное исследование с лабораторным и геномным анализом бактерий. Авторы исследовали ректальные мазки от 1 000 собак с клиническими симптомами и без них, обследованных в ветеринарной клинике на севере Германии в 2017 году. Владельцы заполняли анкету. После лабораторного отбора бактерий авторы анализировали их геномы, искали гены устойчивости и сопоставляли генетическое родство изолятов.

На чём основано · 1

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

In this study, we examined 1,000 rectal swabs obtained from healthy and diseased dogs from a veterinary clinic in northern Germany in 2017. All dogs were examined for health status, and a questionnaire was completed by the owner.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 2

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 3

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

ESBL-producing isolates with completed questionnaires (89 in total) were subjected to whole-genome sequencing on an Illumina MiSeq/NovaSeq 6000 (GATCEurofins-9).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 4

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Of the analyzed isolates, 69% (59 of 85) carried antibiotic resistance genes against three or more antibiotic classes listed by Magiorakos et al. (45) for Enterobacteriaceae and were therefore classified as MDR (45). The comparison of resistance genes between isolates from sick and healthy animals did not reveal any statistically significant differences (P = 0.14). Interestingly, when comparing isolates grouped into commonly pathogenic phylogroups (B2, D, and F) with isolates from commonly apathogenic phylogroups (A, B1, C, and E) (46), a significantly higher number of resistance genes was found in isolates from the commensal phylogroups (P = 0.02, CI: 0.36–6.34; Fig. S1A and B). However, it is important to note that the presence of resistance genes does not necessarily equate to their phenotypic expression or penetrance, which depends on factors such as gene regulation, expression levels, and environmental conditions. This highlights the importance of complementing genomic data with phenotypic resistance testing for a more comprehensive understanding of AMR.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 5

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Four distinct clusters were identified in the phylogenetic tree of ST744. Two of these clusters, clusters I and IV, each contained four samples, while clusters II and III contained two samples each. The core SNP differences ranged from a maximum of 114 to a minimum of 0 (isolates within cluster I). Notably, cluster I of ST744 included isolates from dogs originating from the same breeder (Fig. 2), indicating the circulation of this clonal lineage among animals living in the same household (34, 35) and may be influenced by shared litter boxes and caregivers (7, 36, 37).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 6

Непосредственную передачу бактерий между собаками и людьми в этом исследовании не изучали.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

While direct transmission between dogs and humans was not investigated, the presence of similar lineages across species reinforces the need for continuous surveillance at the animal-human interface.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Размеры выборки в разных разделах статьи следует сохранять раздельно
Этап	Число в статье	Как его понимать
Исходное обследование	1 000 собак	В исследование включали собак с симптомами и без них
Результаты отбора бактерий	85 положительных изолятов	Это число используется в разделе результатов
Полногеномное секвенирование в описании методов	89 изолятов с заполненными анкетами	Причина отличия от числа в результатах в статье не объяснена

На чём основано · 1

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

In this study, we examined 1,000 rectal swabs obtained from healthy and diseased dogs from a veterinary clinic in northern Germany in 2017. All dogs were examined for health status, and a questionnaire was completed by the owner.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 2

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 3

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

ESBL-producing isolates with completed questionnaires (89 in total) were subjected to whole-genome sequencing on an Illumina MiSeq/NovaSeq 6000 (GATCEurofins-9).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 4

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Of the analyzed isolates, 69% (59 of 85) carried antibiotic resistance genes against three or more antibiotic classes listed by Magiorakos et al. (45) for Enterobacteriaceae and were therefore classified as MDR (45). The comparison of resistance genes between isolates from sick and healthy animals did not reveal any statistically significant differences (P = 0.14). Interestingly, when comparing isolates grouped into commonly pathogenic phylogroups (B2, D, and F) with isolates from commonly apathogenic phylogroups (A, B1, C, and E) (46), a significantly higher number of resistance genes was found in isolates from the commensal phylogroups (P = 0.02, CI: 0.36–6.34; Fig. S1A and B). However, it is important to note that the presence of resistance genes does not necessarily equate to their phenotypic expression or penetrance, which depends on factors such as gene regulation, expression levels, and environmental conditions. This highlights the importance of complementing genomic data with phenotypic resistance testing for a more comprehensive understanding of AMR.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 5

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Four distinct clusters were identified in the phylogenetic tree of ST744. Two of these clusters, clusters I and IV, each contained four samples, while clusters II and III contained two samples each. The core SNP differences ranged from a maximum of 114 to a minimum of 0 (isolates within cluster I). Notably, cluster I of ST744 included isolates from dogs originating from the same breeder (Fig. 2), indicating the circulation of this clonal lineage among animals living in the same household (34, 35) and may be influenced by shared litter boxes and caregivers (7, 36, 37).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 6

Непосредственную передачу бактерий между собаками и людьми в этом исследовании не изучали.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

While direct transmission between dogs and humans was not investigated, the presence of similar lineages across species reinforces the need for continuous surveillance at the animal-human interface.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Какие результаты измерили

Гены устойчивости к трём или более классам антибиотиков обнаружены у 59 из 85 проанализированных изолятов. Авторы приводят долю 69% и относят эти изоляты к множественно устойчивым по генетическим признакам. Знаменатель здесь — бактериальные изоляты, включённые в анализ; переносить эту долю на всех обследованных собак нельзя. Сами авторы подчёркивают: наличие гена не обязательно означает проявление соответствующей устойчивости, поэтому геномные данные следует дополнять фенотипическим тестированием.

На чём основано · 1

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

In this study, we examined 1,000 rectal swabs obtained from healthy and diseased dogs from a veterinary clinic in northern Germany in 2017. All dogs were examined for health status, and a questionnaire was completed by the owner.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 2

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 3

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

ESBL-producing isolates with completed questionnaires (89 in total) were subjected to whole-genome sequencing on an Illumina MiSeq/NovaSeq 6000 (GATCEurofins-9).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 4

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Of the analyzed isolates, 69% (59 of 85) carried antibiotic resistance genes against three or more antibiotic classes listed by Magiorakos et al. (45) for Enterobacteriaceae and were therefore classified as MDR (45). The comparison of resistance genes between isolates from sick and healthy animals did not reveal any statistically significant differences (P = 0.14). Interestingly, when comparing isolates grouped into commonly pathogenic phylogroups (B2, D, and F) with isolates from commonly apathogenic phylogroups (A, B1, C, and E) (46), a significantly higher number of resistance genes was found in isolates from the commensal phylogroups (P = 0.02, CI: 0.36–6.34; Fig. S1A and B). However, it is important to note that the presence of resistance genes does not necessarily equate to their phenotypic expression or penetrance, which depends on factors such as gene regulation, expression levels, and environmental conditions. This highlights the importance of complementing genomic data with phenotypic resistance testing for a more comprehensive understanding of AMR.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 5

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Four distinct clusters were identified in the phylogenetic tree of ST744. Two of these clusters, clusters I and IV, each contained four samples, while clusters II and III contained two samples each. The core SNP differences ranged from a maximum of 114 to a minimum of 0 (isolates within cluster I). Notably, cluster I of ST744 included isolates from dogs originating from the same breeder (Fig. 2), indicating the circulation of this clonal lineage among animals living in the same household (34, 35) and may be influenced by shared litter boxes and caregivers (7, 36, 37).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 6

Непосредственную передачу бактерий между собаками и людьми в этом исследовании не изучали.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

While direct transmission between dogs and humans was not investigated, the presence of similar lineages across species reinforces the need for continuous surveillance at the animal-human interface.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Внутри генетической линии ST744 авторы обнаружили близкие изоляты у собак от общего заводчика и интерпретировали это как свидетельство циркуляции линии в общей среде. Для владельца граница вывода такова: генетическое сходство позволяет обсуждать возможную связь находок, но само по себе не устанавливает, какое животное стало источником и в каком направлении происходила передача.

На чём основано · 1

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

In this study, we examined 1,000 rectal swabs obtained from healthy and diseased dogs from a veterinary clinic in northern Germany in 2017. All dogs were examined for health status, and a questionnaire was completed by the owner.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 2

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 3

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

ESBL-producing isolates with completed questionnaires (89 in total) were subjected to whole-genome sequencing on an Illumina MiSeq/NovaSeq 6000 (GATCEurofins-9).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 4

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Of the analyzed isolates, 69% (59 of 85) carried antibiotic resistance genes against three or more antibiotic classes listed by Magiorakos et al. (45) for Enterobacteriaceae and were therefore classified as MDR (45). The comparison of resistance genes between isolates from sick and healthy animals did not reveal any statistically significant differences (P = 0.14). Interestingly, when comparing isolates grouped into commonly pathogenic phylogroups (B2, D, and F) with isolates from commonly apathogenic phylogroups (A, B1, C, and E) (46), a significantly higher number of resistance genes was found in isolates from the commensal phylogroups (P = 0.02, CI: 0.36–6.34; Fig. S1A and B). However, it is important to note that the presence of resistance genes does not necessarily equate to their phenotypic expression or penetrance, which depends on factors such as gene regulation, expression levels, and environmental conditions. This highlights the importance of complementing genomic data with phenotypic resistance testing for a more comprehensive understanding of AMR.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 5

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Four distinct clusters were identified in the phylogenetic tree of ST744. Two of these clusters, clusters I and IV, each contained four samples, while clusters II and III contained two samples each. The core SNP differences ranged from a maximum of 114 to a minimum of 0 (isolates within cluster I). Notably, cluster I of ST744 included isolates from dogs originating from the same breeder (Fig. 2), indicating the circulation of this clonal lineage among animals living in the same household (34, 35) and may be influenced by shared litter boxes and caregivers (7, 36, 37).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 6

Непосредственную передачу бактерий между собаками и людьми в этом исследовании не изучали.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

While direct transmission between dogs and humans was not investigated, the presence of similar lineages across species reinforces the need for continuous surveillance at the animal-human interface.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Что ограничивает выводы

Данные получены в ветеринарной клинике на севере Германии. Исследование не даёт основания считать полученные результаты оценкой для всех собак других регионов или условий содержания.
В статье расходится численность изолятов: 85 в результатах и 89 в методах секвенирования. Причину различия нельзя восполнить предположением об исключении образцов.
Для восьми изолятов геномный поиск не предсказал генов ESBL, хотя бактерии были отобраны по фенотипическим признакам. Это расхождение следует учитывать при чтении результатов.
Прямую передачу между собаками и людьми не исследовали. Работа не определяет вероятность заражения владельца от конкретной собаки.
Исследование описывает бактерии из кишечных образцов и включает собак с симптомами и без них. По этим данным нельзя установить причину заболевания отдельного животного или выбрать для него лечение.

На чём основано · 1

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

In this study, we examined 1,000 rectal swabs obtained from healthy and diseased dogs from a veterinary clinic in northern Germany in 2017. All dogs were examined for health status, and a questionnaire was completed by the owner.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 2

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 3

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

ESBL-producing isolates with completed questionnaires (89 in total) were subjected to whole-genome sequencing on an Illumina MiSeq/NovaSeq 6000 (GATCEurofins-9).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 4

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Of the analyzed isolates, 69% (59 of 85) carried antibiotic resistance genes against three or more antibiotic classes listed by Magiorakos et al. (45) for Enterobacteriaceae and were therefore classified as MDR (45). The comparison of resistance genes between isolates from sick and healthy animals did not reveal any statistically significant differences (P = 0.14). Interestingly, when comparing isolates grouped into commonly pathogenic phylogroups (B2, D, and F) with isolates from commonly apathogenic phylogroups (A, B1, C, and E) (46), a significantly higher number of resistance genes was found in isolates from the commensal phylogroups (P = 0.02, CI: 0.36–6.34; Fig. S1A and B). However, it is important to note that the presence of resistance genes does not necessarily equate to their phenotypic expression or penetrance, which depends on factors such as gene regulation, expression levels, and environmental conditions. This highlights the importance of complementing genomic data with phenotypic resistance testing for a more comprehensive understanding of AMR.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 5

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Four distinct clusters were identified in the phylogenetic tree of ST744. Two of these clusters, clusters I and IV, each contained four samples, while clusters II and III contained two samples each. The core SNP differences ranged from a maximum of 114 to a minimum of 0 (isolates within cluster I). Notably, cluster I of ST744 included isolates from dogs originating from the same breeder (Fig. 2), indicating the circulation of this clonal lineage among animals living in the same household (34, 35) and may be influenced by shared litter boxes and caregivers (7, 36, 37).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 6

Непосредственную передачу бактерий между собаками и людьми в этом исследовании не изучали.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

While direct transmission between dogs and humans was not investigated, the presence of similar lineages across species reinforces the need for continuous surveillance at the animal-human interface.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Что это значит для владельца

Этот разбор помогает различать находку бактерии в образце, обнаружение гена устойчивости и клиническое решение. Редакционный вывод из границ исследования: опубликованные результаты нельзя использовать как диагноз своей собаке или как основание самостоятельно выбирать антибиотик. Если вопрос касается лечения, препарат и дозу назначает ветеринарный врач с учётом конкретного случая.

На чём основано · 1

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

In this study, we examined 1,000 rectal swabs obtained from healthy and diseased dogs from a veterinary clinic in northern Germany in 2017. All dogs were examined for health status, and a questionnaire was completed by the owner.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 2

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 3

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

ESBL-producing isolates with completed questionnaires (89 in total) were subjected to whole-genome sequencing on an Illumina MiSeq/NovaSeq 6000 (GATCEurofins-9).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 4

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Of the analyzed isolates, 69% (59 of 85) carried antibiotic resistance genes against three or more antibiotic classes listed by Magiorakos et al. (45) for Enterobacteriaceae and were therefore classified as MDR (45). The comparison of resistance genes between isolates from sick and healthy animals did not reveal any statistically significant differences (P = 0.14). Interestingly, when comparing isolates grouped into commonly pathogenic phylogroups (B2, D, and F) with isolates from commonly apathogenic phylogroups (A, B1, C, and E) (46), a significantly higher number of resistance genes was found in isolates from the commensal phylogroups (P = 0.02, CI: 0.36–6.34; Fig. S1A and B). However, it is important to note that the presence of resistance genes does not necessarily equate to their phenotypic expression or penetrance, which depends on factors such as gene regulation, expression levels, and environmental conditions. This highlights the importance of complementing genomic data with phenotypic resistance testing for a more comprehensive understanding of AMR.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 5

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Four distinct clusters were identified in the phylogenetic tree of ST744. Two of these clusters, clusters I and IV, each contained four samples, while clusters II and III contained two samples each. The core SNP differences ranged from a maximum of 114 to a minimum of 0 (isolates within cluster I). Notably, cluster I of ST744 included isolates from dogs originating from the same breeder (Fig. 2), indicating the circulation of this clonal lineage among animals living in the same household (34, 35) and may be influenced by shared litter boxes and caregivers (7, 36, 37).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 6

Непосредственную передачу бактерий между собаками и людьми в этом исследовании не изучали.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

While direct transmission between dogs and humans was not investigated, the presence of similar lineages across species reinforces the need for continuous surveillance at the animal-human interface.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 1

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

In this study, we examined 1,000 rectal swabs obtained from healthy and diseased dogs from a veterinary clinic in northern Germany in 2017. All dogs were examined for health status, and a questionnaire was completed by the owner.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 2

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 3

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

ESBL-producing isolates with completed questionnaires (89 in total) were subjected to whole-genome sequencing on an Illumina MiSeq/NovaSeq 6000 (GATCEurofins-9).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

This study examined 1,000 dogs, comprising patients with and without clinical symptoms, from a veterinary clinic in Germany. Rectal swabs were collected in 2017 to screen for ESBL-producing E. coli, resulting in 85 positive isolates. Out of the 85 isolates, 16 were sampled from sick dogs.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 4

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Of the analyzed isolates, 69% (59 of 85) carried antibiotic resistance genes against three or more antibiotic classes listed by Magiorakos et al. (45) for Enterobacteriaceae and were therefore classified as MDR (45). The comparison of resistance genes between isolates from sick and healthy animals did not reveal any statistically significant differences (P = 0.14). Interestingly, when comparing isolates grouped into commonly pathogenic phylogroups (B2, D, and F) with isolates from commonly apathogenic phylogroups (A, B1, C, and E) (46), a significantly higher number of resistance genes was found in isolates from the commensal phylogroups (P = 0.02, CI: 0.36–6.34; Fig. S1A and B). However, it is important to note that the presence of resistance genes does not necessarily equate to their phenotypic expression or penetrance, which depends on factors such as gene regulation, expression levels, and environmental conditions. This highlights the importance of complementing genomic data with phenotypic resistance testing for a more comprehensive understanding of AMR.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 5

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

Four distinct clusters were identified in the phylogenetic tree of ST744. Two of these clusters, clusters I and IV, each contained four samples, while clusters II and III contained two samples each. The core SNP differences ranged from a maximum of 114 to a minimum of 0 (isolates within cluster I). Notably, cluster I of ST744 included isolates from dogs originating from the same breeder (Fig. 2), indicating the circulation of this clonal lineage among animals living in the same household (34, 35) and may be influenced by shared litter boxes and caregivers (7, 36, 37).

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

На чём основано · 6

Непосредственную передачу бактерий между собаками и людьми в этом исследовании не изучали.

Genotypic characterization of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli from dogs in northern Germany.

Условия использования: Creative Commons Attribution (CC BY 4.0): https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Лицензия источника

While direct transmission between dogs and humans was not investigated, the presence of similar lineages across species reinforces the need for continuous surveillance at the animal-human interface.

Связь с утверждением: подтверждает · полный текст · DOI 10.1128/spectrum.00087-25 · опубликован 22 мая 2025

Редакция Породотеки

Об этом материале

Кому и где применимо: Для владельцев собак, которые хотят понять результаты исследования устойчивых кишечных бактерий. Выводы ограничены обследованными собаками ветеринарной клиники на севере Германии и полученными от них бактериальными изолятами.

Проверка и история

Опубликовано: 25 октября 2026
Проверено: 25 октября 2026
Финансирование: В разделе «Благодарности» статьи указана поддержка Фонда открытых публикаций Университета ветеринарной медицины Ганновера и Федерального министерства образования и научных исследований Германии в рамках проекта DISPATch_MRGN. Влияние финансирования на результаты в этом разборе не оценивалось.

Постоянный адрес материала.

25 октября 2026 · Опубликована версия

Сообщить об ошибке